南水北調集團目前已有7家直接持股或控股子公司，分別為：

南水北調中線干線工程建設管理局（持股比例100%）

南水北調東線總公司（持股比例100%）

中國南水北調集團新能源投資有限公司（持股比例100%）

中國南水北調集團水務投資有限公司（持股比例100%）

中國南水北調集團綜合服務有限公司（持股比例100%）

中國南水北調集團江漢水網建設開發(fā)有限公司（持股比例100%）

南水北調（開化）水務有限公司（持股比例36%）

據企查查顯示，中國南水北調集團江漢水網建設開發(fā)有限公司法人為高必華。

公司經營范圍包括：

工程項目建設管理與運行；水網規(guī)劃、建設開發(fā)與運營；水生產供應；水生態(tài)保護；水污染治理；水文化旅游資源開發(fā)運營 ；項目投資；工程總承包和專業(yè)承包；工程咨詢及技術服務；工程勘察設計；電力生產；物業(yè)服務；軟件和信息系統(tǒng)集成開發(fā)及運行維護；土砂石開采；礦產資源（非煤礦山）開采。

中國南水北調集團有限公司于2020年10月23日在京正式成立，是經國務院批準，根據《中華人民共和國公司法》設立，由中央直接管理的國有獨資有限公司。

公司注冊資本暫定為1500億元人民幣，是關系國家水資源安全和國民經濟命脈的大型國有重點骨干企業(yè)。公司于2020年9月在市場監(jiān)管部門完成企業(yè)工商登記。法定代表人為國務院南水北調辦副主任、水利部副部長蔣旭光。2020年以前由水利部代表國務院管理，此后轉歸國務院國資委管理。